Remerciez-le!

Remerciez @Admin pour avoir partagé cet document gratuitement, de la manière la plus simple, en partageant sur les réseaux sociaux.

UNIVERSITE SIDI MOHAMED BEN ABDELLAH FACULTE DES SCIENCES ET TECHNIQUES DE FES

UNIVERSITE SIDI MOHAMED BEN ABDELLAH FACULTE DES SCIENCES ET TECHNIQUES DE FES Projet de Fin d’Etudes Licence Sciences & Techniques «BioProcédés, Hygiène & sécurité alimentaires» Présenté par : Encadré par : -Mlle SUIFFI Kawtar -Pr. HAGGOUD Abdellatif (FST,Fès) - Pr. BENNANI Bahia (FMP,Fès) Soutenu le : 5 Juin 2018 Devant le jury composé de :  Mme BENNANI Bahia (FMP,Fès)  Mr HAGGOUD Abdellatif (FST, Fès)  Mme El ABED Soumya (FST, Fès) Année universitaire 2017/2018 Etude de la résistance des staphylocoques isolés à partir des aliments à la méticilline (précisément à la céfoxitine) UNIVERSITE SIDI MOHAMED BEN ABDELLAH FACULTE DES SCIENCES ET TECHNIQUES DE FES Projet de Fin d’Etudes Licence Sciences & Techniques «BioProcédés, Hygiène & sécurité alimentaires» Présenté par : Encadré par : -Mlle SUIFFI Kawtar -Pr. HAGGOUD Abdellatif (FST,Fès) - Pr. BENNANI Bahia (FMP,Fès) Soutenu le : 5 Juin 2018 Devant le jury composé de :  Mme BENNANI Bahia (FMP,Fès)  Mr HAGGOUD Abdellatif (FST, Fès)  Mme El ABED Soumya (FST, Fès) Année universitaire 2017/2018 Etude de la résistance des staphylocoques isolés à partir des aliments à la méticilline (précisément à la céfoxitine) Dédicace Je dédie ce modeste travail : A la mémoire de mon père, Qu’il puisse reposer en paix. A ma douce et tendre mère, le symbole de la tendresse, du courage, de la responsabilité et de l’amour ... Les mots ne suffisent pas pour exprimer toute l'affection que j'éprouve pour toi. Que Dieu te garde, te comble de santé, et te donne longue vie. A mes chers frères, ma fierté dans cette vie. A ma tendre, gentille et adorable sœur , Que le grand Dieu vous offre un avenir plein de réussite et de bonheur . A mes chères amies à qui j’exprime mes plus profonds sentiments d'amour. je les remercie pour le sourire qu'elles ont su toujours dessiner sur mon visage, et pour les bons moments qu'on a passé ensemble. A tous mes Professeurs et mes collègues, Votre collaboration et votre aide m’ont été très précieuses. Remerciements Je commence par remercier Dieu le tout Puissant qui m’a donné la capacité d’achever ce travail et qui m’a aidé a dépassé toutes les difficultés que j’ai rencontrées. Je lui demande de guider mes pas dans le chemin qui méritera son approbation. Je voudrai présenter mes remerciements en premier lieu à la direction et l'ensemble du personnel de la Faculté de Médecine et de Pharmacie de Fès , de m'avoir accueilli parmi eux pour effectuer un stage au sein du laboratoire de Microbiologie et Biologie Moléculaire, dans les meilleures conditions. J'adresse ma reconnaissance à Pr. Bahia Bennani pour avoir acceptée de diriger ce travail, je lui adresse tout mes remerciements pour sa compréhension , son respect et son humanité . Je tiens particulièrement à remercier mon encadrant de mémoire Pr. Abdellatif Haggoud qui a accepté favorablement de m'encadrer pendant ce stage et qui m'a guidé avec ses précieux conseils, je lui exprime mes profondes gratitudes et mes sincères remerciements. Un merci particulier à Pr. Soumya El Abed pour avoir accepté de juger et d'évaluer ce travail. Je tiens à remercier aussi Melle .Ghita Benjelloune qui m' a aidée pendant toute la durée de ce stage. Résumé : Cette étude a été menée au sein du laboratoire de Microbiologie et Biologie Moléculaire à la Faculté de Médecine et de Pharmacie- Fès. Nous nous sommes proposés dans cette étude d'évaluer le niveau de résistance à la méticilline (céfoxitine) pour différentes souches de Staphylococcus isolées à partir des aliments. L'ensemble des résultats obtenus montrent que la majorité des souches isolées sont des staphylocoques à coagulase négative (69%). De plus, l'analyse des résultats de l'antibiogramme montrent que parmi les 100 souches que nous avons étudiées, 45 sont résistantes à la céfoxitine (45%). Des taux de résistance plus élevés concernant les souches isolées à partir des viandes crues (62%), des viandes cuites (40%) et des salades (52%) sont enregistrés. Concernant les proportions de résistance pour les staphylocoque à coagulase négative et les staphylocoques à coagulase positive sont les mêmes avec un taux de 45%. Mots clés : Staphylococcus, résistance à la céfoxitine, résistance à la méticilline , aliments Sommaire: Dédicace ............................................................................................................................................ Remerciements .................................................................................................................................. Résumé .............................................................................................................................................. Liste des tableau et figures ................................................................................................................ Liste des abréviations ........................................................................................................................ Introduction .................................................................................................................................... 1 Chapitre I : Revue Bibliographique I. Les Staphylocoques ..................................................................................................................... 2 I-1.Caractéristique générales ....................................................................................................... 2 I-2. Taxonomie ............................................................................................................................ 2 I-3. Types des staphylocoque ...................................................................................................... 3 II. Les staphylocoques dans les aliments ........................................................................................ 4 II-1. Les aliments incriminés dans les intoxications par les staphylocoques .............................. 4 II-2.Les intoxications alimentaires causées par les staphylocoques ........................................... 4 II-3. Épidémiologie ..................................................................................................................... 5 III. La résistance des Staphylococcus à la céfoxitine ..................................................................... 6 III-1. Antibiotiques..................................................................................................................... 6 III-1-1. Définition ...................................................................................................................... 6 III-1-2. Type des antibiotiques .................................................................................................. 6 III-1-3. Spectres d'action ............................................................................................................ 7 III-1-3-1.action Sur la paroi bactérienne ........................................................................... 7 III-1-3-2. Action Sur la membrane cytoplasmique ........................................................... 7 III-1-3-3. Action Sur l'ARN ribosomique ......................................................................... 7 III-1-3-4. Action Sur l'ADN bactérien .............................................................................. 7 III-2. La résistance Bactérienne ...................................................................................................... 8 III-2-1. Définition......................................................................................................................... 8 III-2-2. Les types de résistance .................................................................................................... 8 III-2-3. Résistances des staphylocoques ...................................................................................... 9 III-2-4. Résistance des staphylocoques à la méticilline ............................................................. 10 Chapitre II: Matériel et Méthodes I. Plan d'étude ................................................................................................................................ 12 II. Lieu et période de l’étude ......................................................................................................... 12 III. Matériels et milieux utilisés ................................................................................................................... 12 III-1. Les échantillons ............................................................................................................................... 12 III-2. Milieux de culture ............................................................................................................ 13 III-2-1. Milieux de purification ............................................................................................. 13 III-2-2. Milieu utilisé pour l'antibiogramme .................................................................................... 13 III-2-3. Milieu d'enrichissement BHI ........................................................................................... 13 III-2-4. Disques d'Antibiotiques ........................................................................................................ 13 IV. Méthodologie ........................................................................................................................................... 13 IV-1. Identification ................................................................................................................................... 14 IV-2. L'antibiogramme ....................................................................................................................... 15 Chapitre III : Résultats et discussion I.Résultats ...................................................................................................................................... 17 I-1. La distribution globale des staphylocoques ............................................................................ 17 I-2. Résultats de la résistance des staphylocoques à la céfoxitine ................................................ 18 I-2-1. Résultats globale d'antibiogramme de la céfoxitine ....................................................... 18 I-2-2. Résultats de l'antibiogramme selon l'origine des prélèvements ..................................... 18 I-2-3. Résultats de résistance à la céfoxitine selon le type du staphylocoque ........................ 19 II.Discussion ................................................................................................................................. 21 Conclusion .................................................................................................................................... 23 Références Bibliographiques ........................................................................................................ 24 Liste des tableaux et figures : Liste des tableaux: Tableau 1: les types des staphylocoques..................................................................................3 Tableau 2: Origine des échantillons.......................................................................................12 Liste des Figures : Figure 1 : Répartition des Staphylococcus.............................................................................17 Figure 2: Pourcentages globales de résistance et de sensibilité à la céfoxitine......................18 Figure 3: La résistance et la sensibilité selon l'origine d'isolement .......................................19 Figure 4: La résistance et la sensibilité à la céfoxitine selon le type de staphylocoque.........20 Liste des Abréviations: -SARM : Staphylococcus aureus résistants à la méticilline -SASM : Staphylococcus aureus sensibles à la méticilline -SCN : Staphylococcus à coagulase négative -SCP : Staphylococcus à coagulase positive - T.I.A : toxi-infections alimentaires - TIAC : toxi-infections alimentaires collectives - Milieu MH : Mueller-Hinton -Milieu BHI : Brain Heart infusion - InVS : Institut de veille sanitaire -SE : Entérotoxine staphylococcique Introduction: Staphylococcus est une bactérie ubiquitaire , présente dans notre écosystème cutané. Avec les streptocoques et les pneumocoques constituent un groupe d’agents pathogènes à Gram positif opportunistes et envahissants [1]. Le genre Staphylococcus apparait dans la littérature à la fin du XIXe siècle [2]. Cette bactérie occupe aujourd’hui, à part sa virulence et sa résistance aux antibiotiques usuels, une grande importance en pathologie humaine dont la prévalence des infections augmente régulièrement [2]. Staphylococcus aureus, l’espèce la plus virulente du genre Staphylococcus, a émergé comme l’un des agents pathogènes humains les plus importants, et a été au cours des dernières décennies, une des principales causes de nombreuses intoxications alimentaires et d'infections hospitalières et communautaires [3]. Staphylococcus aureus provoque un large éventail d’infections cliniques, allant des infections courantes telles que les infections de la peau et des tissus mous à des infections meurtrières comme la septicémie, la pneumonie [4]. L’une des raisons qui expliquent le succès de ce pathogène, est son importante variabilité survenant à différentes périodes et lieux avec divers types de clones et profils de résistance aux antibiotiques selon les régions et les pays. [5]. Cette augmentation de la résistance aux antibiotiques est un sujet de préoccupation important. En outre les différents types de staphylocoques qui sont résistants à la méticilline sont résistants également à tous les autres antibiotiques de la même classe. Ce qui augmente le risque d'intoxication pour le consommateur. Cette résistance est liée à leur grande plasticité génomique qui peut être acquise ou apportée par un plasmide ou d’autres éléments mobiles (cassette chromosomique staphylococcique, transposons, bactériophages, Séquences d’insertion) [6]. Dans ce contexte, l'objectif de notre recherche consiste en l'identification bactérienne des différents isolats de staphylocoques obtenus à partir des aliments , et l'étude de leur profil de résistance à la méticilline. Chapitre I : Revue Bibliographique I .Les staphylocoques : I-1. Caractéristiques générales : Les staphylocoques sont des bactéries de type Cocci à Gram positif, qui se retrouvent fréquemment chez les personnes en bonne santé, habituellement dans la muqueuse du nez. La bactérie peut ensuite coloniser d’autres régions, via les mains, et en particulier les parties humides du corps comme les aisselles ou la zone génitale. [7]. Staphylococcus est un pathogène humain majeur qui a été mis uploads/Geographie/etude-de-la-resistance-des-sta-kawtar-suiffi-4664.pdf