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Isolement d x27 une bacterie antibiogramme dr bessede

Méthodes d ?isolement d ?une bactérie Antibiogramme Emilie Bessède Laboratoire de Bactériologie CHU Pellegrin Etapes classiques du diagnostic bactériologique ? Examen macroscopique ? Examen microscopique direct numération leucocytaire état frais - coloration de Gram ? Mise en culture du prélèvement ? Identi ?cation - antibiogramme C Examen macroscopique ? trouble GR débris odeur ? Examen microscopique ? GB GR bactéries levures cristaux ? ? numération leucocytaire C Examen microscopique ? Coloration du prélèvement par la coloration de Gram ? Morphologie des bactéries bacilles - cocci ? Couleur rose Gram négatif - violet Gram positif CStreptocoque Méningite à N meningitidis coloration de Gram C Méningite à N meningitidis coloration de Gram Ensemencement ? Obtention des bactéries en culture nécessaire à l ?identi ?cation et aux tests de sensibilité aux antibiotiques ? Milieux de culture adaptés aux bactéries à rechercher gélosés ou liquides - ordinaires enrichis ou sélectifs ? Incubation dans une atmosphère adaptée ? Délai de culture variable C Techniques d ? ensemencement ? en quadrants ? calibré quanti ?cation des bactéries possible ECBU LBA Exemple de di ?érents milieux utilisés ? LBA ?? Géloses au sang ?? Géloses chocolat ?? Gélose BCP ? Urines ?? BCP ? LCR ?? Géloses au sang ?? Géloses chocolat ?? Bouillons C Incubation des di ?érents milieux ? Atmosphère à C plus ou moins enrichie en CO ? Atmosphère anaérobie à C Identi ?cation des bactéries ? Exigences de culture ? Couleur aspect odeurs des colonies gélosés ou liquides - ordinaires enrichis ou sélectifs ? Recherche de caractères respiratoires oxydase catalase ? Recherche de caractères biochimiques galeries d ?identi ?cation C Identi ?cation des bactéries Automatisation des identi ?cations ? Utilisation de galeries automatisées et miniaturisées ?? Délai de à h C Principe de la spectrométrie de masse MALDI-TOF Visualisation d ?un spectre ? ? ? ? ? ? ? CTableau de scores Interprétation des cultures ? La ou les bactéries isolées sont elles potentiellement pathogènes ? La ou les bactéries isolées sont elles en situation pathogène ? Réalisation d ?un antibiogramme en milieu gélosé - en milieu liquide automatisé C L ?antibiogramme ? C'est la détermination de la sensibilité d'une bactérie aux antibiotiques ? Intérêt comparer la valeur de la CMI d'un antibiotique par rapport à celle de deux concentrations critiques c et C mg L Il permet de catégoriser la souche à étudier en confrontant la CMI d'un antibiotique donné à celle de la concentration c ou C Catégorisation clinique S I R ? Souches Sensibles Probabilité de succès thérapeutique forte en cas de traitement systémique à posologie recommandée AFSSAPS ? Souches Résistantes Forte probabilité d ?échec thérapeutique quel que soit le type de traitement et la posologie ? Souches Intermédiaires Succès thérapeutique imprévisible car - dissociation in vitro - in vivo mécanisme de résistance faible cédant à une forte concentration locale ou à une augmentation de posologie - recouvre les incertitudes techniques et biologiques C Détermination de la CMI ? Dé ?nition faible concentration d ?antibiotique qui inhibe tout croissance bactérienne