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Cours derivemigrationmetapopfstat ens 2009 pdf

Génétique des populations Dérive migration extinction et F-statistiques Module ENS Rapha? l Leblois leblois mnhn fr Maitre de conférence Muséum National d'Histoire Naturelle UMR Origine Structure et Evolution de la biodiversité CLes mécanismes de l ? évolution ? ? Pour expliquer les mécanismes responsables des changements évolutifs il faut développer une modélisation mathématique de l ? évolution Gr? ce aux modèles on peut prédire la vitesse des changements dans une population et comprendre comment ces changements dépendent des divers facteurs qui agissent dans les populations CLes mécanismes de l ? évolution ? ? Les mathématiques de l ? évolution ont commencé à être développés dans les années - Ronald A Fisher - Sewall Wright - John BS Haldane - CLa génétique des populations ? ? Décrire les génotypes estimer leur fréquence et celle des allèles déterminer leur distribution au sein des individus des populations et entre les populations ? ? Prédire et comprendre l ? évolution des fréquences des gènes dans les populations sous l ? e ?et de di ?érents facteurs ou forces évolutives ? CLa génétique des populations ? ? Théorique nécessaire pour tester des hypothèses ou des modèles verbaux et produire de nouvelles hypothèses ? ? Expérimentale consiste à tester des modèles et leurs hypothèses dans des conditions contrôlées ? ? Empirique description de la distribution du polymorphisme dans des populations naturelles inférence de l ? histoire démographique et adaptative des populations naturelles CRépartition de la variabilité génétique ? ? A l ? intérieur même des individus ? ? Entre individus Zea mais Cepea nemoralis CRépartition de la variabilité génétique Variation entre sous-populations Marsilea strigosa ? ? Peu de polymorphisme au sein des mares mais une forte di ?érenciation entre mares CRépartition de la variabilité génétique Variation entre populations Arabidopsis thaliana ? ? polymorphismes SNPs ou indels issus de l ? analyse de séquences obtenues parmi individus pb CQuelques dé ?nitions ? G ? ène copie d'une information génétique portée par une séquence de nucléotides ? ? Locus emplacement d'un gène sur un chromosome ? ? Allèle ou état allélique classe de gènes homologues au même locus tous équivalents Deux gènes sont dans le même état allélique si l'information qu'ils portent est codée par la même séquence d'ADN ou s'ils sont la copie exacte d'un ancêtre commun Un individu diplo? de possède donc deux gènes homologues à un locus son génotype et ces gènes peuvent avoir le même état allélique individu génotype homozygote ou non individu génotype hétérozygote CQu ? est-ce qu ? un marqueur ? ? On utilise des marqueurs génétiques pour analyser de façon empirique la distribution du polymorphisme à l ? intérieur des individus des populations entre populations ? ? ? Un marqueur génétique idéal ? doit ?? ? Avoir un déterminisme simple et connu ex mendélien ?? ? Être polymorphe ?? ? Être co-dominant ?? ? Être neutre vis-à-vis de la sélection naturelle si l ? on s ? intéresse a la démographie uniquement CLes marqueurs génétiques ? ? Allozymes Isozymes Marqueurs enzymatiques