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Page 1 sur 16 DIPLÔME INTER-UNIVERSITAIRE CESAM Centre d’Enseignement de la Sta

Page 1 sur 16 DIPLÔME INTER-UNIVERSITAIRE CESAM Centre d’Enseignement de la Statistique Appliquée, à la Médecine et à la biologie médicale Président d’honneur, fondateur : Pr Daniel SCHWARTZ Directeur : Pr Fabrice CARRAT Pr Fabrice CARRAT Pr Anne-Claude CAMPROUX Brochure d’inscription et d’information Année universitaire 2019-2020 Page 2 sur 16 Table des matières Sommaire 2 Présentation du CESAM 3 Les quatre modules du DIU-CESAM 4 METHO 6 STARC 8 EPIQ 9 STAB 10 DATA 11 Cours informatique 12 Organisation de l’enseignement 13 Enseignement suivi à distance 14 Examens 15 Règles d’obtention du diplôme 16 Règle de conservation des notes 16 Pour tout renseignement ou correspondance, s’adresser à: Faculté de médecine Sorbonne Université Site Saint Antoine Département d’enseignement/CESAM 27 rue Chaligny 75571 – PARIS cedex 12 Tél : 01 40 01 14 45 Mail : medecine-dfs-cesam@sorbonne-universite.fr Conservez cette brochure, elle vous sera utile au cours de l’année Page 3 sur 16 Le Centre d’Enseignement de la Statistique à la Santé Publique, à la Médecine et à la Biologie (CESAM) propose une série de cours de formation pratique à l’utilisation de la méthode statistique dans le domaine biomédical ainsi qu’aux méthodes de l’épidémiologie et de la recherche clinique. Ces cours sont organisés dans le cadre d’un Diplôme Inter-Universitaire (DIU) délivré par les Universités Sorbonne Université et Denis Diderot-Paris 7, dans le cadre de la Formation Continue de Sorbonne Université. L’enseignement du CESAM s’adresse à tous ceux (médecins, biologistes, vétérinaires, pharmaciens, techniciens, étudiants) qui souhaitent pouvoir utiliser la méthode statistique dans les domaines de la recherche médicale ou dans leur vie professionnelle. Le niveau général requis est celui d’une fin de 3 ème année de premier cycle, L3. L’enseignement n’exige pas une formation particulière en mathématique ou statistique. Il est cependant vrai qu'on y manipule beaucoup de chiffres e t d e formules. L’expérience montre que l'enseignement du CESAM demande 6 à 8 heures de travail personnel hebdomadaire. L’enseignement peut être suivi en travaux dirigés à Paris, Lyon et Bordeaux ou à distance. Pour les étudiants inscrits par correspondance, des stages de révision sont organisés chaque semestre. Les examens ont lieu en présentiel à Paris UNIQUEMENT. Page 4 sur 16 Dans le cadre du DIU-CESAM, 5 modules sont proposés, dont les programmes sont détaillés dans les pages qui suivent :  Méthodologie Statistique (METHO), 1er semestre  Statistiques en Recherche Clinique – Méthodes et pratique (STARC), 2ème semestre  Épidémiologie - Principes et Méthodes Quantitatives (EPIQ), 2ème semestre  Statistique en Biologie expérimentale (STAB), 2ème semestre  Sciences des Données et apprentissage statistique (DATA), 2ème semestre Le diplôme du CESAM est composé du module METHO, obligatoire, et de l’un des quatre modules STARC, EPIQ, STAB OU DATA. Par ailleurs, un cours de Logiciel Informatique (R, SAS) est proposé (même tarif qu’un module) mais celui-ci est non validant du DIU CESAM. Tous les modules peuvent être étudiés en présentiel, avec TD, ou par correspondance, via un site MOODLE MEDECINE. Le module de méthodologie statistique (METHO) porte sur les méthodes de base utilisées dans le domaine biomédical : Sans entrer dans le détail du formalisme mathématique, il présente le mode de raisonnement statistique, et les principales méthodes d'estimation et de test. L'accent est mis sur l’interprétation concrète des résultats obtenus et sur les conclusions qui peuvent en être tirées en pratique. Le module de Recherche Clinique (STARC) concerne principalement les essais thérapeutiques : Le module Statistiques en Recherche Clinique – Méthodes et pratique est surtout consacré à la méthodologie des essais thérapeutiques comparatifs : préalable, conception, méthodes d’analyse statistique, interprétation des résultats, lecture critique d'articles. Ce module donne en outre des notions sur les études pronostiques, les méta-analyses et les études diagnostiques. Le module d’Epidémiologie (EPIQ) concerne les enquêtes en population par opposition aux options de Recherche Clinique qui ne porte que sur des sujets malades: Le module Epidémiologie - Principes et Méthodes Quantitatives couvre aussi l’ensemble des méthodes allant de l’établissement du protocole à l’exécution de l’analyse. Il détaille particulièrement l’analyse des enquêtes épidémiologiques, et notamment les méthodes d’analyse multivariée. Page 5 sur 16 Le module Statistique en biologie (STAB) est plus particulièrement orienté vers la biologie expérimentale : Il est consacré aux méthodes statistiques utilisées en expérimentation (animale et in vitro). L’enseignement porte sur les plans expérimentaux utilisés en biologie expérimentale et les essais biologiques. Le module de Sciences des Données (DATA) concerne l’apprentissage statistique et les modèles à visée prédictive : Le module Sciences des Données ouvre aux méthodes utilisées dans la conception, la réalisation et l’évaluation des modèles prédictifs, notamment à l’aide d’approches d’apprentissage statistique. Le cours présente les méthodes supervisées et non supervisées, la sélection de variables prédictives selon la nature des variables résultats et le recours à la pénalisation, à la méthodologie de validation et d’estimation de l’erreur. Le cours informatique est dédié à l’analyse informatique des données de santé, de la gestion de données jusqu’aux étapes de modélisation statistique. La formation inclue une combinaison de deux logiciels : R et SAS. Page 6 sur 16 METHO : Yann DE RYCKE L’objectif de cet enseignement est de présenter le mode de raisonnement statistique et d’apprendre les méthodes de base utilisées dans le domaine biomédical. Un accent particulier est mis sur l’interprétation concrète des résultats statistiques et sur les conclusions qui peuvent en être tirées en pratique. - Fluctuations d’échantillonnage, utilisation des tables statistiques - Intervalle de confiance d’un pourcentage et d’une moyenne - Principe des tests statistiques - Comparaison de deux pourcentages (test du Khi2), de deux moyennes (test de Student) et de deux variances (test de Fisher) - Mesure d'association entre deux variables qualitatives à deux classes : le rapport des cotes (odd's ratio) - Puissance d’un test statistique pour comparer deux moyennes et deux pourcentages - Régression linéaire, corrélation - Comparaison de plusieurs pourcentages, test de tendance entre plusieurs pourcentages - Comparaison de plusieurs moyennes, analyse de la variance - Test de linéarité - Introduction aux tests non-paramétriques : Test de Mann-Whitney, Test des signes de Wilcoxon, Test de normalité de Kolmogorov-Smirnov. L’enseignement dure 14 semaines d’octobre à fin janvier avec une interruption pendant les vacances universitaires de Noël. Chaque semaine comprend un cours de 2h et un TD de 2h. Deux stages de révision de 8h permettent aux étudiants inscrits par correspondance (les étudiants inscrits en présentiel peuvent y participer), de revoir les notions essentielles et de participer à un enseignement interactif. L’examen a lieu à la Faculté de Médecine de la Pitié-Salpêtrière. Page 7 sur 16 Inscription aux TD et cours de méthodologie PARIS Cours: Les cours ont lieu toutes les semaines 2h Mardi de 17h45 à 19h45 Travaux Dirigés: les séances de T.D. ont lieu à la Faculté de Médecine de la Pitié- Salpêtrière, une fois par semaine 2h, de 17h45 à 19h45. Vous aurez le choix entre 4 TD de 17h45 à 19h45. Le planning vous sera communiqué sur un calendrier récapitulatif, lors de l’envoi des documents de travail, après l’inscription. Vous ne recevrez pas de confirmation; présentez-vous directement au T.D. de votre choix lorsque vous aurez le planning définitif PROVINCE - Bordeaux La première séance de travaux dirigés aura lieu début octobre 2019, de 18h à 20h, à l ’Université de Bordeaux, site Carreire. Pour tout renseignement complémentaire s’adresser au Secrétariat pédagogique du Pr. SALAMON par tél au 05.57.57.10.43 ou par mail luc.Letenneur@isped.u-bordeaux2.fr ou luc.letenneur@inserm.fr. - Lyon La première séance de travaux dirigés aura lieu début octobre 2019 de 17h30 à 19h30, Domaine Rockefeller de l’Université Claude Bernard, 8 avenue Rockefeller, 69008 LYON. Page 8 sur 16 STARC : Sylvie CHEVRET L’objectif de cet enseignement est de permettre aux personnes, travaillant dans un milieu de recherche clinique, de planifier, de conduire et d’analyser des essais thérapeutiques comparatifs ou des études diagnostiques. Il s’appuie sur les connaissances statistiques acquises lors du module de méthodologie statistique et développe la méthodologie propre à la recherche clinique, notamment le calcul du nombre de sujets nécessaires, l’analyse simple de plans expérimentaux usuels, l'estimation et la comparaison de courbes de survie, la réalisation d'études pronostiques. Il introduit en outre aux méta-analyses et aux études diagnostiques. Sur le plan pratique, l’enseignement s’appuie sur des exemples d’études publiées dans des pathologies variées avec un accent particulier pour la cancérologie. - Essais thérapeutiques (partie la plus développée de l’enseignement):  Formulation d’un essai  Définition des traitements, des malades et des critères  Tirage au sort et conduite de l’essai  Nombre de sujets nécessaires  Plans expérimentaux  Rédaction d’un protocole  Analyse des résultats et portées des conclusions - Techniques d’ajustement - Estimation et comparaisons des courbes de survie : Méthode de Kaplan-Meier, Méthode actuarielle, Logrank - Introduction aux techniques de méta-analyse - Réalisation et interprétation des enquêtes pronostiques - Évaluation et comparaison des méthodes diagnostiques - Discussion de résultats d'essais publiés. L’enseignement à lieu sur le site de Paris 7 Diderot, il dure 14 semaines, de février à juin, avec une interruption pendant les vacances universitaires de printemps. Chaque semaine comprend un cours et un TD de 2h. Deux stages de révision de 8h permettent aux étudiants inscrits uploads/Science et Technologie/ brochure-diu-cesam-2019-20.pdf