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Tp 1 sequencage et separation des genomes

TP Séquençage et comparaison des génomes humains La structure de l'ADN a été découverte en Il a fallu attendre pour disposer de la première séquence complète du génome humain c'est-à-dire de l'intégralité des chromosomes de notre caryotype Génome ensemble de l ? information contenue dans la succession des bases ou séquence de l ? ADN présent dans chaque cellule d ? un organisme Le séquençage d ? un génome consiste à déterminer la totalité de cette séquence On se propose de montrer en quoi les données issues du séquençage de l ? ADN humain apportent de nouvelles informations sur les génomes des individus et permettent de déterminer leurs relations de parenté Activité Connaitre le génome humain Pb Comment le séquençage du génome humain a-t-il été déterminé Doc Les premiers génomes séquencés Séquencer un génome consiste à conna? tre l'encha? nement des bases de l'ensemble de l'ADN contenu dans les cellules d'un organisme Doc La méthode de séquençage de Sanger En Frederick Sanger invente une méthode de séquençage de l'ADN par synthèse enzymatique L'ADN polymérase va progressivement synthétiser un nouveau brin en utilisant des nucléotides normaux ou uorescents D'abord utilisée pour des petits fragments d'ADN cette méthode sera progressivement améliorée pour gagner en rapidité et analyser des génomes entiers Les premiers génomes entiers ont été séquencés avec la méthode de Sanger Doc Exemple de séquence La méthode a pu être automatisée dans des machines appelées séquenceurs analysant séquences à la fois Les séquences obtenues peuvent se présenter comme une succession de pics de uorescence L'ordre de ces pics donne la séquence Expliquer le principe et l ? intérêt de chacune des étapes du séquençage CActivité Mon histoire inscrite dans mon génome Pb Comment peut-on déterminer nos origines à partir de notre ADN Partie Les données de l ? ADN mitochondrial Document d ? appel Squeezie vidéaste francophone je découvre mes origines ? Consigne Barnabé a commandé sur internet un kit de test ADN pour déterminer ses origines Les résultats reçus indiquent qu ? il a une origine européenne avec une forte probabilité d ? après son ADN mitochondrial A partir de l ? analyse des documents et données ci dessous justi ?ez cette conclusion Document ADN mitochondrial On peut trouver de nombreuses di ?érences si on compare l ? ADN de deux individus Les variations les plus abondantes ne portent que sur un seul nucléotide On les appelle des SNP single-nucleotide polymorphism Elles sont le résultat de mutations ponctuelles passées Elles peuvent être présentes dans les gènes mais aussi en dehors Elles peuvent survenir dans l ? ADN nucléaire ou l ? ADN mitochondrial Elles sont assez fréquentes tous les à nucléotides environ et sont relativement stables dans le temps sur plusieurs générations C ? est pourquoi on peut les utiliser dans la phylogénie humaine Pour ce type d ? étude l ? ADN mitochondrial ou celui du chromosome Y présentent l ? avantage d ? être moins soumis aux recombinaisons échanges entre chromosomes Ils racontent toutefois deux histoires complémentaires car